Cyclin-Dependent Kinase inhibitor 2A (CDKN2A) - 3,469 nt intron 01 reference sequence

(intronic numbering for coding DNA Reference Sequence)
alternative transcript op p16 extending into intron 1
         .         .         .         .         .         .
gtgggtagagggtctgcagcgggagcaggggatggcgggcgactctggaggacgaagttt  150+60
V  G  R  G  S  A  A  G  A  G  D  G  G  R  L  W  R  T  K  F    p.Phe50+20

         .         .         .         .         .         .
gcaggggaattggaatcaggtagcgcttcgattctccggaaaaaggggaggcttcctggg  150+120
A  G  E  L  E  S  G  S  A  S  I  L  R  K  K  G  R  L  P  G    p.Gly50+4

         .         .         .         .         .         .
gagttttcagaaggggtttgtaatcacagacctcctcctggcgacgccctgggggcttgg  150+180
E  F  S  E  G  V  C  N  H  R  P  P  P  G  D  A  L  G  A  W    p.Trp50+60

         .         .         .         .         .         .
gaagccaaggaagaggaatgaggagccacgcgcgtacagatctctcgaatgctgagaaga  150+240
E  A  K  E  E  E  X                                           p.Glu50+66

         .         .         .         .         .         .
tctgaaggggggaacatatttgtattagatggaa | gtatgctctttatcagatacaaaatt  150+300
                                   | differential splice site
         .         .         .         .         .         .
tacgaacgtttgggataaaaagggagtcttaaagaaatgtaagatgtgctgggactactt  150+360

         .         .         .         .         .         .
agcctccaattcacagatacctggatggagcttatctttcttactaggagggattatcag  150+420

         .         .         .         .         .         .
tggaaatctgtggtgtatgttggaataaatatcgaatataaattttgatcgaaattattc  150+480

         .         .         .         .         .         .
agaagcggccgggcgcggtgcctcacgccttgtaatcccttcactttgggagatcaaggc  150+540

         .         .         .         .         .         .
ggggggaatcacctgaggtcgggagttcgagaccagcctggccaacaggtgaaacctcgc  150+600

         .         .         .         .         .         .
ctctactaaaaatacaaaaagtagccgggggtggtggcaggcgcctgtaatcccagctac  150+660

         .         .         .         .         .         .
tcgggaggttgaggcaggagaatcgcttgaacccgggaggctgaggttgtagtgaacagc  150+720

         .         .         .         .         .         .
gagatggagccacttcactccagcctgggtgacagagtgagactttgtcgaaagaaagaa  150+780

         .         .         .         .         .         .
agagagaaagagagagagaaaaattattcagaagcaactacatattgtgtttatttttaa  150+840

         .         .         .         .         .         .
ctgagtagggcaaataaatatatgtttgctgtaggaacttaggaaataatgagccacatt  150+900

         .         .         .         .         .         .
catgtgatcattccagaggtaatatgtagttaccattttgggaatatctgctaacatttt  150+960

         .         .         .         .         .         .
tgctcttttactatctttagcttacttgatatagtttatttgtgataagagttttcaatt  150+1020

         .         .         .         .         .         .
cctcatttttgaacagaggtgtttctcctctccctactcctgttttgtgagggagttagg  150+1080

         .         .         .         .         .         .
ggaggatttaaaagtaattaatacatgggtaacttagcatctctaaaattttgccaacag  150+1140

         .         .         .         .         .         .
cttgaacccgggagtttggctttgtagtcctacaatatcttagaagagaccttatttgtt  150+1200

         .         .         .         .         .         .
taaaaacaaaaaggaaaaagaaaagtggatagttttgacaatttttaatggagacgggag  150+1260

         .         .         .         .         .         .
aagaacatgtagaaaaggggaaatgatgttggcttagaatcctaactacattggtgttta  150+1320

         .         .         .         .         .         .
atataggaacatttatttatataacattttaaagtactaaattcatattagtatattatc  150+1380

         .         .         .         .         .         .
aaatggatatattatcaaatgggtttaagcatcctacacattttaattcaattgattcat  150+1440

         .         .         .         .         .         .
tttctttttgctttggatttctatcatgatttaaatatttacatatgggttactttttag  150+1500

         .         .         .         .         .         .
atttttcatactatgaaatataagaaaaacctttaaggctagttttatgaccaagacgaa  150+1560

         .         .         .         .         .         .
ggacttcattgaatacacaaaacaataaatatactgcaacattttgtctttctttttgta  150+1620

         .         .         .         .         .         .
gctgcaatttggtttgcttatactttctctttgtctctttgaaaactgagtcagtttcac  150+1680

         .         .         .         .         .     
tttctcaggacaggatttaataaccataatataatttagtataattccttgattt  150+1735

--------------------- middle of intron ---------------------
          .         .         .         .         .         
      aggcaaattatgcaatttgtgtttagtatgaaatgtacctaaaaataagtaact  151-1681

.         .         .         .         .         .         
cctctttaacaccaccatcctcaaactaatataacaaataacagttatcctaaaataaat  151-1621

.         .         .         .         .         .         
tgtctacttccaccatgcagcactcaaattttaaggttgctatgactgcagacagtattt  151-1561

.         .         .         .         .         .         
taaaattcctctctggaaatggctttgtttccaagatgatttaggaaccaaagaggtgac  151-1501

.         .         .         .         .         .         
catctcttgtttaatgaactctcaaatcataaacctgggaagtgttttagtttcctactg  151-1441

.         .         .         .         .         .         
ctgctgttacaaattatcacaaatgtgttagctaaaacaaacacaaaattattattttac  151-1381

.         .         .         .         .         .         
agttctagagatcagaagtcaaaaatgggtccacaaggtttcattccttttggaaactct  151-1321

.         .         .         .         .         .         
aaggggcaatctgtttccttgtcttttccagcttctagtgaccatcaaattccttggctc  151-1261

.         .         .         .         .         .         
atggtctctgtattttctctgtggcctgtgcttccattcttgtatcttctctctgactgt  151-1201

.         .         .         .         .         .         
gaccctctaataaaaacacttggggttatgttgggcccaccctgaaaattctggataatc  151-1141

.         .         .         .         .         .         
tccctcaagaccattaattaaatcacatctgcaaagcctcttttgccacataagttaatg  151-1081

.         .         .         .         .         .         
tattaaaagtttttgaggattaggacatagacattgggggtgggggggcattattcagcc  151-1021

.         .         .         .         .         .         
taccacaggaaggaattttagggttaattaaactagccttcttattttatacttgaagaa  151-961

.         .         .         .         .         .         
attgaagttttggaattggagagcattatgctaaatgaaataagccaaacacagaaagac  151-901

.         .         .         .         .         .         
aaatatcacatgttctcacttatctgtgaaatataaaacaattacattcttagcagtaaa  151-841

.         .         .         .         .         .         
gagtagaatggtggttactagagctggggggtgggaggaatggggagatggtaatcaaga  151-781

.         .         .         .         .         .         
tataaagcctcagttaagatgggaggaataagtttgattgttttttttgagatgtgtttc  151-721

.         .         .         .         .         .         
atagcatgatgaatatagctaaatagtaaatcccaaatgctctcatttgacaaaaatgtc  151-661

.         .         .         .         .         .         
aaatatttgagatgatggataggttacttagcttgacttaataattccccattgtgttca  151-601

.         .         .         .         .         .         
aagatcataacttcatattgtaccacataaatatatacaactgtactatcccaatatata  151-541

.         .         .         .         .         .         
attttaaaactaatataatgaaaaagaaattgaagttcaacattcccagaagctaagtgt  151-481

.         .         .         .         .         .         
aacttaaaagttttgtgagaatttgttttaacaaacaaacaagttttctctttttaacaa  151-421

.         .         .         .         .         .         
ttaccacattctgcgcttggatatacagcagtgaacaaaaaaaaaaaaaaaaatctccag  151-361

.         .         .         .         .         .         
gcctaacataatttcaggaagaaatttcagtagttgtatctcaggggaaatacaggaagt  151-301

.         .         .         .         .         .         
tagcctggagtaaaagtcagtctgtccctgcccctttgctattttgcccgtgcctcacag  151-241

.         .         .         .         .         .         
tgctctctgcctgtgacgacagctccgcagaagttcggaggatataatggaattcattgt  151-181

.         .         .         .         .         .         
gtactgaagaatggatagagaactcaagaaggaaattggaaactggaagcaaatgtaggg  151-121

.         .         .         .         .         .         
gtaattagacacctggggcttgtgtgggggtctgcttggcggtgagggggctctacacaa  151-61

.         .         .         .         .         .         
gcttcctttccgtcatgccggcccccaccctggctctgaccattctgttctctctggcag  151-1